SPOILERS
Τα επεισόδια 25 και 26 δεν αποτελούν μέρος της αρχικής έμπνευσης του Hideaki Anno, αλλά απαιτήθηκαν από την Gainax για να ολοκληρωθεί ομαλά το concept του κύκλου. Για όσους δεν το έχουν προσέξει, το κείμενο στην αρχή του 25ου μας προϊδεάζει ότι αυτό, περίπου, είναι το πετυχημένο Human Instrumentality Project, αν κι εφόσον δεχθούμε ότι δεν υπάρχει παρέμβαση ή προβληματισμός εκ μέρους Shinji.
Από την άλλη, οι ταινίες ολοκληρώνουν θεματικά την αρχική ιδέα από το επεισόδιο 24. Επισήμως, τα επεισόδια 25 και 26 έχουν χαρακτηριστεί alternate storyline. Ουσιώδης λεπτομέρεια είναι ότι, αν προσέξετε, νεκροί και ζωντανοί ανεξαιρέτως γίνονται μέρος του αμνιακού, σχεδόν, υγρού Liquid of Life, Rei's Life Blood, που, μάλλον όχι τυχαία, είναι απαράλλαχτο με το Link Connection Liquid (LCL) που έχουν τα entry plugs (να θυμήσουμε εδώ ότι το LCL έχει οσμή αίματος και είναι αναπνεύσιμο, ακριβώς όπως και το αμνιακό υγρό, δημιουργώντας πολλούς παράλληλους συμβολισμούς). Αυτό υποδεικνύει, κρίνοντας από την Asuka, ότι όποιος θέλει μπορεί ν' απαρνηθεί το HIP και να επιστρέψει ως φυσική ύπαρξη στον κόσμο.
Από την άλλη, το manga έχει το απίστευτο καλό ότι οι χαρακτήρες είναι λιγότερο φιγούρες ενός δράματος που δεν μπορούν να σταματήσουν και πολύ περισσότερο ανθρώπινοι. Ο δε θάνατος του Toji, ας πούμε, είναι αναγκαίος, πλέον, για την καταβαράθρωση της διάθεσης του Shinji, αφού πλέον το στοιχείο που τον χαρακτηρίζει δεν είναι η παραίτηση, αλλά ότι έχει μπαϊλντίσει.